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故事主角「冴羽獠」是地下社會中聞風喪膽的殺手，擁有頂尖戰技和槍法，但生性非常好色。與搭檔「慎村香」一同經營以新宿為據點的偵探事務所，接下保鑣工作的條件，通常是美女的請託。劇場版主軸環繞在阿獠接受委託的客人初登場角色「近藤亞衣」。另一方面，與主角亦敵亦友的貓眼咖啡館老闆「海怪」，注意到新宿周邊集結了許多傭兵，事件背後的幕後主使目標竟然也是亞衣…...

人類與妖獸的戰爭已進行了數千年，人類亦成立了特警對付妖獸。妖獸分為兩派，一派融入人類社會，控制經濟命脈，與人類共處；另一派則試圖消滅人類，稱霸世界。 市面上出現了一種叫「快樂」的毒藥，控制人類思想，以毀滅人類為目標。加山隊長計劃捉拿名義上是大集團董事長，實際卻是妖獸的元大宗（仲代達矢　飾）。瀧蓮三郎（黎明　飾）在三年前曾與美女妖獸幻姬（李嘉欣　飾）展開一段戀情，無奈人鬼殊途，不得不放棄而遠走東京。此次回到香港的阿瀧卻發現幻姬已成為元大宗的情婦。元大宗嚮往和平，但他的兒子鬼眾道卻是個激進分子。 ...

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