電影:

在網路世界中，奧米加獸與啟示錄獸死後邪惡的化身梅菲斯獸交手。奧米加獸指出梅菲斯獸意欲危害全世界，要置其於死地，卻不慎被它逃到現實世界。現實世界裡，啟人暑假為了代替父母掃墓來到沖繩，與表兄弟浦添海救下了一個被數碼獸追趕的少女上原美波。這些數碼獸，似乎想要搶奪少女所帶的手提電腦。備受歡迎的電子寵物V-Pet背後，到底隱藏著什麼陰謀？為保護美波而誕生的石獅獸，究竟有何不同尋常之處？現實世界出現了一群邪惡的數碼獸襲擊人類的電腦系統，使全世界陷入一片恐慌之中，啟人遇到了危險，留姬和健良也分別遭遇邪惡數碼獸...

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花咲蕾和來海繪理香於某天早上醒來，發現希普蕾、可芙蕾不見了，照著精靈所留下的字條與地圖，來到了東京灣的「精靈樂園」，並在人群中找的了精靈，和遊客愛等四人一同參觀遊玩。不料海中的敵人「深海」，讓許多過去的敵人復活侵入，想奪取支撐樂園的彩虹寶石(レインボージュエル，Rainbow Jewel)。 沒想到，除了桃園愛一行人一樣和花咲蕾二人會變身成光之美少女外，身旁還出現了其他的戰士一同參戰。眼看樂園被敵人摧毀，彩虹寶石又位於樂園中的哪裡呢？...

「以日本橫濱的摩天輪為舞台，14 名光之美少女們同心協力引起不可思議的彩虹奇蹟！」 桃園愛一行人前往橫濱港未來 21 參加舞蹈比賽，卻在途中迷路了。正在驚慌尋找會場的時候，企圖吞噬一切的新敵人突然出現。在敵人面前，所有的光之美少女陸續登場。為了維護世界不被黑暗掩蓋且從敵人手中救出雪芳，14 人因而團結一心產生引導未來以及希望的彩虹奇蹟，共同合作打敗惡勢力。...

光之美少女們意外進入了夢的世界，在那裡遇到了可以操縱夢的妖精，並且陷入危險之中......最後解決了惡夢獸也解救了孩子。...

時間線為 Healin' Good ♥ 光之美少女最終話以後，和佳一行人來到東京，在那裏人們通過戴上“夢之項鍊”，可以體驗能反映出自己夢想的“夢之 R”。期間和佳一行人結識了夢之 R 的公主——輝夜，然而這時一夥企圖搶奪人們夢想的神秘敵人突然現身，為了守護輝夜及大家的夢想，和佳一行人所在的 Healin' Good ♥ 光之美少女將與來自 Yes! 光之美少女 5 的成員一起，展開一場驚心動魄的戰鬥與大冒險！...

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在 DX3 終結時，官方於片末表示 DX3 為「All Stars DX 的結束」，但仍然在 Suite 光之美少女的電影版片末公開新作消息，指出 New Stage 是和 DX 截然不同的作品展開。本作並沒有先前三部 DX 之名的作品出現歷代所有光之美少女作互動，僅以 Suite、Smile 組以及原創主角為主，而有關做法曾被各方大肆批評沒有尊重開創系列的前數代。...

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