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宇宙世紀 0079、地球聯邦和自護公國之間的一年戰爭末期。SIDE 4 中漂流著宇宙殖民地群、姆亞殘骸的暗礁宙域，由於交織著帶電太空垃圾所引發的閃電，而被稱為「雷霆宙域」。為了搶回這片宙域，隸屬聯邦軍的姆亞同胞團開始展開作戰。迎擊的對手則是自護軍的活死人師團。雖為姆亞同胞團一員，卻對受限於故鄉一事不以為然的伊歐，與失去雙腳、在活死人師團作為王牌狙擊手活躍的戴瑞，將在這片宙域展開命運的相會！...

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特殊技能訓練學校「美濱學園」的狙擊手桐花,與民間委託型間諜人才培育組織「SORD」的成員們共同參加海外聯合訓練,沒想到竟被捲入一場祕密作戰,被迫變更計畫,參與追查聖愛爾外國人學校的逃脫者「惠」。然而,在執行任務期間,桐花下定決心認真面對與父母的記憶,以及與昔日友人志保之間未完成的約定,同時臆測惠的境遇,得出了某個答案…...

這是人類的體內，許多的細胞勤奮工作的世界。某日白血球（嗜中性球）與紅血球，遇見了收留迷路乳酸菌的一般細胞。為了將乳酸菌護送至同伴所在的的方，白血球與一般細胞朝著腸子前進。然而他們卻與來者不善的最強敵人重逢。再次現身的癌細胞。以及遭到壞菌破壞的腸內環境。體內遭遇前所未有的大危機？！「束手就擒吧 癌細胞！」為了守護這個世界，白血球們為了世界的命運，奮勇加入這場血腥大戰。...

以培育國防人才為目的的 SORD 與全國各地學校展開合作。廢校後被閒置的“美濱學園”被私人收購，成為了「特殊技能訓練學校」。因各種理由而失去了容身之處的少女們，在這裡被賦予了武器，並以國防的名義派遣她們執行一個又一個危險的任務。無論遭受何等苦難，卻選擇拿起武器繼續戰鬥的少女們的未來會是……...

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